Boekhoudsoftware Fysiotherapie: Beste Keuze voor Je Praktijk (2026)

Als fysiotherapeut heb je geen fysio-specifieke boekhoudsoftware nodig, maar een gewone Nederlandse boekhoudtool die btw-aangifte, facturatie en bankenkoppeling automatiseert. Jortt (7,8/10) is de beste keuze dankzij de Boekhoudbot die 95% automatiseert, terwijl e-Boekhouden.nl (vanaf €9,95/mnd) de goedkoopste optie is voor startende praktijken.
Waarom fysiotherapeuten andere boekhoudbehoeften hebben
Een fysiotherapiepraktijk draait anders dan een gemiddelde zzp'er met uurtarieven. Je werkt met zorgverzekeraars, hebt soms meerdere behandelaren in dienst, en de btw-regels liggen net anders dan bij reguliere dienstverlening.
Fysiotherapie is grotendeels vrijgesteld van btw als het gaat om reguliere, door de Wmg gereguleerde zorg. Dat betekent dat je geen btw rekent over je behandelingen, maar ook geen btw mag terugvragen over je inkoop. Verkoop je daarnaast producten (zoals taping of supplementen) of geef je trainingen die niet onder zorg vallen, dan gelden daar wél gewone btw-regels op.
Dit maakt het kiezen van boekhoudsoftware net iets specifieker. Je hebt een pakket nodig dat btw-vrijstellingen correct kan verwerken naast normale btw-boekingen, en dat overzicht geeft in cliëntenbetaling via zowel zorgverzekeraar als eigen bijdrage.
SoftwareKiezer test boekhoudpakketten op precies dit soort praktijksituaties. In onze complete gids over boekhoudsoftware lees je hoe we tot onze scores komen voor verschillende ondernemersprofielen, waaronder zorgverleners.
Meer tijd voor zorg: wat automatisering je oplevert

Elke minuut die je besteedt aan administratie is een minuut die je niet aan patiënten besteedt. De juiste software verandert dat.
Minder administratie voor je fysio- of oefentherapiepraktijk
Moderne boekhoudprogramma's koppelen automatisch met je bank, herkennen bonnetjes via foto's, en stellen concept-facturen op. Jortt doet dit via de Boekhoudbot, die volgens de vendor 95% van de reguliere boekhoudtaken automatiseert (bron: jortt.nl, gecheckt april 2026). Dat scheelt je gemiddeld enkele uren per week aan handmatig invoerwerk.
Altijd en overal inzicht
Met een cloudgebaseerd pakket zie je 24/7 via mobiel of laptop hoe je praktijk ervoor staat. Moneybird en e-Boekhouden.nl bieden beide een mobiele app waarmee je onderweg bonnetjes kunt scannen of je omzet kunt checken tussen behandelingen door.
Vergroot cliënt-betrokkenheid
Facturatie die snel en overzichtelijk is, straalt professionaliteit uit naar je patiënten. FreshBooks biedt bijvoorbeeld client portals waarin cliënten hun facturen en betaalstatus kunnen inzien — ideaal als je naast reguliere zorg ook particuliere behandelingen factureert.
Welke boekhoudsoftware past bij jou?
Beantwoord 5 vragen en vind het perfecte boekhoudpakket
Waar bestaat de fysio-boekhouding uit?
Een fysiotherapiepraktijk heeft meestal met deze onderdelen te maken:
- Facturatie aan zorgverzekeraars
- declaraties via Vecozo of directe facturatie, afhankelijk van je contractvorm
- Btw-vrijstelling op zorg
- reguliere fysiotherapie is vrijgesteld, randproducten niet
- Personeelsadministratie
- als je met meerdere fysiotherapeuten werkt, heb je loonadministratie nodig
- Inkoopfacturen
- behandelmaterialen, huur praktijkruimte, abonnementen software
- Kilometerregistratie
- voor huisbezoeken of visites bij patiënten thuis
Tellow heeft bijvoorbeeld ingebouwde kilometerregistratie, wat relevant is als je regelmatig bij patiënten langsgaat.
Prijzen van boekhoudsoftware voor fysiotherapeuten

| Plan | Prijs | Voor wie | Highlights |
|---|---|---|---|
| e-Boekhouden.nl ZZP Pakket | €9,95/mnd (eerste 12 mnd €4,98) | Solo-fysiotherapeut, startende praktijk | Max. 240 boekingen/jaar, onbeperkt factureren, telefonische support |
| Moneybird Start | €18/mnd | Freelance fysiotherapeut | Bonnetjes scannen, bankkoppeling, modernste interface |
| Jortt ZZP | €21,95/mnd | Fysiotherapeut die minimale administratietijd wil | Boekhoudbot automatiseert 95%, IB-aangifte inbegrepen |
| Tellow Basis | €14,99/mnd | Zzp'er die simpel wil boekhouden | Onbeperkt factureren, btw-aangifte, kilometerregistratie |
| Exact Online Plus | €99/mnd | Praktijk met meerdere fysiotherapeuten in loondienst | Debiteurenbeheer, 100 facturen/mnd, 2 gebruikers |
Prijzen geverifieerd april 2026, zie de officiële pricing-pagina's van Jortt en Moneybird voor actuele tarieven.
Voor wie is welk pakket bedoeld?
Als je als eenpitter werkt, heb je waarschijnlijk genoeg aan e-Boekhouden.nl of Tellow. Beide zijn goedkoop, simpel en bieden btw-aangifte zonder overbodige features die je niet gebruikt.
Jortt is dan de logische keuze. De Boekhoudbot herkent bonnetjes en bankmutaties automatisch, en het pakket regelt ook je IB-aangifte — dat laatste is uniek onder de budgetvriendelijke opties.
Zodra je personeel in dienst neemt of meerdere vestigingen hebt, wordt Exact Online relevant. Het pakket groeit mee van simpel boekhouden naar een volledig ERP-systeem met personeelsmodules.
Werk je met expats of patiënten uit het buitenland en wil je Engelstalige facturen met strakke client portals? FreshBooks is dan sterk, al mist het Nederlandse btw-aangifte — je moet dan apart btw regelen.
Feature-vergelijking voor fysiopraktijken
| Feature | Jortt | Moneybird | e-Boekhouden.nl | Tellow |
|---|---|---|---|---|
| BTW-aangifte | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ |
| Kilometerregistratie | ✗ | ✗ | ✗ | ✓ |
| Bonnetjes scannen | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ |
| Mobiele app | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ |
| IB-aangifte | ✓ | ✗ | ✗ | ✗ |
| Telefonische support | ✓ | ✗ | ✓ | ✗ |
| Meerdere gebruikers | Vanaf MKB-plan | Vanaf Groei-plan | Gratis onbeperkt | Vanaf Plus-plan |
Slimme automatisering in de praktijk
De meeste fysiotherapeuten hebben geen boekhoudkundige achtergrond, en dat hoeft ook niet. Slimme software neemt het grootste deel van het denkwerk over.
Scan- en herkenfunctionaliteit is daarbij onmisbaar: je maakt een foto van een bonnetje voor behandelmateriaal en de software herkent automatisch bedrag, btw en categorie. Lees meer hierover in onze gids over boekhoudprogramma's met scan en herken.
Bankkoppeling is een tweede essentiële feature. Zodra een zorgverzekeraar of patiënt betaalt, matcht de software dit automatisch aan de juiste factuur. Onze uitgebreide uitleg over boekhoudprogramma bankkoppeling laat zien welke tools dit het beste doen.
Integraties die relevant zijn voor fysiotherapiepraktijken
- Bankkoppeling
- directe koppeling met ING, ABN AMRO, Rabobank en andere NL-banken voor automatische matching van betalingen
- Agendasoftware
- sommige boekhoudpakketten koppelen (via Zapier) met praktijkagenda's zodat afspraken automatisch tot facturen leiden
- Vecozo/declaratiesoftware
- aparte zorgdeclaratiesystemen draaien los van je boekhouding, maar de uitkomst (betalingen) moet je wel kunnen matchen
- Salarisadministratie
- relevant zodra je fysiotherapeuten in loondienst hebt, vooral bij Exact Online beschikbaar via koppelmodules
Nederlandse btw-regels specifiek voor fysiotherapeuten
Fysiotherapie kent een aantal fiscale bijzonderheden die internationale vergelijkingssites zoals Capterra of G2 niet behandelen, maar die wel direct invloed hebben op welke boekhoudsoftware geschikt is.
Reguliere fysiotherapeutische zorg is vrijgesteld van btw op basis van de medische vrijstelling in de btw-wetgeving. Dat betekent: je rekent geen btw aan patiënten of zorgverzekeraars, maar je kunt ook geen btw terugvragen over inkoopfacturen zoals behandelbanken of huur. Verkoop je naast zorg ook producten (brace, tape, supplementen) of geef je niet-medische trainingen, dan geldt daarvoor wel gewoon het normale btw-tarief. Je boekhoudsoftware moet dus btw-vrijgestelde en btw-plichtige omzet apart kunnen bijhouden.
Val je onder de kleineondernemersregeling (KOR) omdat je naast fysiotherapie ook kleine nevenactiviteiten hebt met een omzet onder €20.000 per jaar, dan hoef je over die nevenactiviteit geen btw te rekenen, maar vraag je ook geen btw terug. Lees de voorwaarden na in onze uitleg over de kleineondernemersregeling (KOR) 2026 voordat je hiervoor kiest.
Werk je met een eenmanszaak, dan loopt je boekhouding via de inkomstenbelasting (IB); heb je een bv, dan via de vennootschapsbelasting (VPB). Jortt is hier bijzonder omdat het als een van de weinige budgetpakketten zowel IB- als VPB-aangifte ondersteunt, wat relevant is als je twijfelt tussen een eenmanszaak of bv-structuur voor je praktijk.
Houd daarnaast rekening met de wettelijke bewaarplicht van 7 jaar voor je administratie, en met de aangiftetermijn voor btw: deze moet uiterlijk de laatste dag van de maand na het aangiftetijdvak binnen zijn. Check voor actuele regels altijd de Belastingdienst of raadpleeg je accountant.
💡 Let op: Belastingadvies in dit artikel is algemeen. Raadpleeg je accountant voor specifieke situaties, zeker rondom de medische btw-vrijstelling en nevenactiviteiten.
Veelvoorkomende valkuilen bij fysio-administratie
Btw-vrijstelling en nevenactiviteiten door elkaar boeken
Veel fysiotherapeuten boeken inkomsten uit productverkoop of trainingen onder dezelfde btw-vrijgestelde categorie als hun zorgomzet.
Zorg dat je boekhoudsoftware aparte grootboekrekeningen heeft voor btw-vrijgestelde zorg en btw-plichtige nevenactiviteiten. Vraag bij twijfel je accountant om dit in te richten.
Kilometervergoeding niet bijhouden
Huisbezoeken en visites worden vaak niet apart geregistreerd, waardoor je reiskostenaftrek misloopt.
Kies een pakket met ingebouwde kilometerregistratie, zoals Tellow, of gebruik een aparte app die koppelt met je boekhouding.
Verkeerde rechtsvorm-koppeling
Praktijken die overstappen van eenmanszaak naar bv vergeten hun boekhoudsoftware hierop aan te passen, waardoor IB- en VPB-aangiftes door elkaar lopen.
Check of je pakket beide aangiftevormen ondersteunt (zoals Jortt) of stap over naar een pakket dat past bij je nieuwe rechtsvorm.
Geen suppletie indienen bij fouten
Een verkeerd geboekte btw-vrijstelling wordt soms pas na de aangifte ontdekt, en ondernemers vergeten dit te corrigeren.
Dien op tijd een suppletie in. Lees onze uitleg over suppletie btw: wanneer en hoe corrigeer je je aangifte voor de stappen.
Facturen niet voldoen aan wettelijke eisen
Facturen aan zorgverzekeraars of particuliere patiënten missen soms verplichte gegevens zoals KvK-nummer of btw-status.
Gebruik de factuursjablonen van je boekhoudpakket en check onze gids over factuur maken: verplichte gegevens en stappenplan.
Wie kiest wat?
Kies Jortt als je
- Zo min mogelijk tijd aan boekhouding wilt besteden
- Zowel IB- als VPB-aangifte nodig hebt
- Telefonische Nederlandse support belangrijk vindt
- Een eenmanszaak of kleine bv hebt
- Bereid bent iets meer te betalen voor automatisering
Kies e-Boekhouden.nl als je
- Een beperkt budget hebt als startende praktijk
- Niet meer dan 240 boekingen per jaar hebt
- Vooral telefonisch geholpen wilt worden
- Nog geen personeel in dienst hebt
- Prioriteit geeft aan lage kosten boven een moderne interface
Lees ook onze complete Boekhoudsoftware gids voor een uitgebreid overzicht en stappenplan.
Direct bekijken
Wil je de twee pakketten uit dit artikel zelf proberen? Bekijk Jortt of bekijk e-Boekhouden.nl. Zoek je nog een ander pakket voor een praktijk waar je vooral diensten verkoopt, kijk dan ook naar MoneyMonk en DigiBoox. Die bespreken we in ons artikel over de beste Moneybird-alternatieven.
Conclusie
Voor fysiotherapeuten is er geen speciale "fysio-boekhoudsoftware" nodig — een goed Nederlands boekhoudpakket met correcte btw-vrijstellingsverwerking volstaat. Jortt is onze topkeuze dankzij de automatisering en IB/VPB-ondersteuning, terwijl e-Boekhouden.nl de beste optie is als je kosten wilt minimaliseren.
Twijfel je nog welk pakket bij jouw praktijk past? Vergelijk alle boekhoudsoftware op SoftwareKiezer en bekijk de actuele prijzen direct bij de bron. Lees ook onze complete gids over boekhoudsoftware voor een dieper vergelijkend overzicht per ondernemersprofiel.
Veelgestelde vragen
Welke boekhoudsoftware is het beste voor fysiotherapeuten?
Moet ik btw rekenen over fysiotherapiebehandelingen?
Welk boekhoudpakket houdt kilometers bij voor huisbezoeken?
Kan ik declaraties aan zorgverzekeraars via mijn boekhoudsoftware regelen?
Is Exact Online nodig voor een fysiotherapiepraktijk met meerdere behandelaren?
Hoe lang moet ik mijn praktijkadministratie bewaren?
Vergelijk alle boekhoudsoftware tools
Bekijk onze complete vergelijking met features, prijzen en reviews. Onafhankelijk beoordeeld, transparant gescoord.
Naar de Boekhoudsoftware vergelijking